Гобустанский район расположен к востоку от Шамахы, в 101 км от Баку. Рельеф территории Гобустана – ущелья, овраги, скалы – нашёл своё отражение в топониме («гобу» - «балка, лощина»). У Гобустана богатый растительный покров. 470 из 4000 видов растений, произрастающих в Азербайджане, приходятся на Гобустан. Большинство составляют цветочные растения.  Гобустан является естественной физико-географической местностью, однако часть его территории входит в Хызинский, Абшеронский, Гарадагский и Гаджигабулский административные районы. Основная же его часть (1369,4 км2) входит в образованный 24 апреля 1990 года Гобустанский административный район. Его территория за небольшими исключениями совпадает с территорией бывшего Маразинского района. Район простирается на расстояние 51 км с севера на восток и 45 к с востока на запад. Рельеф Гобустанского административного района горный и очень сложный. Согласно орографии он разделён на три части – плоскогорье, холмогорье и равнины. В горах у Аджыдяря развился глиняный карст. По этой причине здесь распространён типичный карстовый ландшафт. Большую роль в формировании рельефа Гобустана играли ветра, осадки и грязевые вулканы. На территории района расположены Джяйирли, Шорсулу, Коланы, Шейхсярли, Годуг гыран и другие грязевые вулканы.